Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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TRIP11Q15643 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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TRIP11Q15643 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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TRIP11Q15643 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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TRIP11Q15643 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TRIP11Q15643 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TRIP11Q15643 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TRIP11Q15643 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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