Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDSNQ15517 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms