Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 FAM20A-203ENST00000590074 1642 ntTSL 218.87■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 FAM20A-201ENST00000226094 3668 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 TRIM27-204ENST00000467742 541 ntTSL 24.31□□□□□ -1.724e-14■■■■■ 37.9
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SF3B4Q15427 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.39e-8■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 PIP5K1A-201ENST00000349792 3767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.479e-8■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.479e-8■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 PIP5K1A-216ENST00000486866 600 ntTSL 37.6□□□□□ -1.199e-8■■■■■ 37.9
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SF3B4Q15427 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 AP5Z1-204ENST00000477680 3081 ntTSL 212.77□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 SLC38A3-201ENST00000417121 491 ntTSL 515.88■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 37.8
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SF3B4Q15427 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 37.8
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SF3B4Q15427 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.29e-10■■■■■ 37.8
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SF3B4Q15427 RPL8-204ENST00000526668 717 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.099e-10■■■■■ 37.8
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SF3B4Q15427 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.867e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 CARD19-202ENST00000466409 2291 ntTSL 1 (best)20.22■□□□□ 0.837e-8■■■■■ 37.8
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SF3B4Q15427 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.257e-8■■■■■ 37.8
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SF3B4Q15427 ATF3-206ENST00000366987 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.727e-8■■■■■ 37.8
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SF3B4Q15427 APLP2-215ENST00000530493 1322 ntTSL 210.07□□□□□ -0.87e-8■■■■■ 37.8
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SF3B4Q15427 UBTF-207ENST00000529042 535 ntTSL 38.91□□□□□ -0.987e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.027e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 AARS-204ENST00000566969 610 ntTSL 28.68□□□□□ -1.027e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.097e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 AP3B1-207ENST00000522901 1170 ntTSL 37.79□□□□□ -1.167e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 BBS4-209ENST00000566197 541 ntTSL 37.51□□□□□ -1.217e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 ATF3-205ENST00000366985 516 ntTSL 57.16□□□□□ -1.267e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 CDC25C-204ENST00000503022 1059 ntTSL 36.63□□□□□ -1.357e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 ATF3-203ENST00000366981 680 ntTSL 1 (best)6.39□□□□□ -1.397e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 KIF21A-210ENST00000551264 3161 ntTSL 26.26□□□□□ -1.417e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 KIF21A-207ENST00000547733 3535 ntTSL 26.02□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 KIF21A-213ENST00000552961 4120 ntTSL 1 (best)5.08□□□□□ -1.67e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 BBS4-216ENST00000569151 272 ntTSL 34.57□□□□□ -1.687e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.717e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 AP3B1-206ENST00000520122 525 ntTSL 34.37□□□□□ -1.717e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 MAN2A1-204ENST00000505313 793 ntTSL 24.24□□□□□ -1.737e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 KIF21A-214ENST00000636569 6157 ntTSL 53.93□□□□□ -1.787e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 JMJD1C-206ENST00000483298 772 ntTSL 23.83□□□□□ -1.87e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.817e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 MAN2A1-206ENST00000513921 2193 ntTSL 23.53□□□□□ -1.847e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 MAN2A1-203ENST00000503970 5599 ntTSL 23.53□□□□□ -1.847e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 KRR1-205ENST00000551070 673 ntTSL 23.33□□□□□ -1.887e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 JMJD1C-201ENST00000327520 3781 ntTSL 21.8□□□□□ -2.127e-8■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 NFYA-201ENST00000341376 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 37.8
SF3B4Q15427 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.413e-9■■■■■ 37.7
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