Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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PRKD1Q15139 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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PRKD1Q15139 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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PRKD1Q15139 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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PRKD1Q15139 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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PRKD1Q15139 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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