Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HDM1Q15032 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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