Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
GAPVD1Q14C86 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GAPVD1Q14C86 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
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