Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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