Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
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