Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms