Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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GTF2H3Q13889 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H3Q13889 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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