Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTB1Q13884 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTB1Q13884 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms