Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTCH1Q13635 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
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