Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRQ13535 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRQ13535 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRQ13535 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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