Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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MTM1Q13496 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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MTM1Q13496 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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MTM1Q13496 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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MTM1Q13496 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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MTM1Q13496 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTM1Q13496 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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MTM1Q13496 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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MTM1Q13496 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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MTM1Q13496 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTM1Q13496 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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