Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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