Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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SNTA1Q13424 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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