Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms