Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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