Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME3Q13232 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME3Q13232 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME3Q13232 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME3Q13232 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME3Q13232 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME3Q13232 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME3Q13232 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME3Q13232 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME3Q13232 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME3Q13232 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME3Q13232 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME3Q13232 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME3Q13232 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME3Q13232 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME3Q13232 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME3Q13232 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME3Q13232 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME3Q13232 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME3Q13232 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME3Q13232 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME3Q13232 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NME3Q13232 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME3Q13232 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME3Q13232 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME3Q13232 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME3Q13232 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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