Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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