Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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