Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
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