Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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