Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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PTPRJQ12913 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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PTPRJQ12913 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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PTPRJQ12913 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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