Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms