Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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