Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 SWA2YDR320C 2007 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 YJL015CYJL015C 285 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 OST1YJL002C 1431 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 NOP6YDL213C 678 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 SMX2YFL017W-A 234 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 HHF2YNL030W 312 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 PHO81YGR233C 3537 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 BUD3YCL014W 4911 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 MSM1YGR171C 1728 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 YJR056CYJR056C 711 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 YBL096CYBL096C 309 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 YBP1YBR216C 2025 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 ALG1YBR110W 1350 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 EPO1YMR124W 2832 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 APM3YBR288C 1452 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 YGR293CYGR293C 462 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 YML003WYML003W 873 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 BNI1YNL271C 5862 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 FIN1YDR130C 876 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 SIR3YLR442C 2937 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 GPP2YER062C 753 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 YPR177CYPR177C 372 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 TFA1YKL028W 1449 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 VBA4YDR119W 2307 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 TMA64YDR117C 1698 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 PEX21YGR239C 867 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 CTK2YJL006C 972 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 ISF1YMR081C 1017 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 HPA2YPR193C 471 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YER138CYER138C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YER160CYER160C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YJR027WYJR027W 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YML039WYML039W 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YML045WYML045W 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YMR050CYMR050C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 VPS3YDR495C 3036 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YPR089WYPR089W 2667 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 RIM13YMR154C 2184 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 TAM41YGR046W 1158 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YIL102CYIL102C 306 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YLR462WYLR462W 609 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 CSF1YLR087C 8877 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 AGE1YDR524C 1449 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 ATG32YIL146C 1590 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 CLB4YLR210W 1383 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YAE1YJR067C 426 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 FOL3YMR113W 1284 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 PKR1YMR123W 369 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 UBP8YMR223W 1416 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 CDC73YLR418C 1182 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 SYH1YPL105C 2550 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 ATP17YDR377W 306 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 NDL1YLR254C 570 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 MRPL33YMR286W 261 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 SPO75YLL005C 2607 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 SNF11YDR073W 510 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 GLG2YJL137C 1143 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YNL235CYNL235C 432 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 PCK1YKR097W 1650 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 RNR4YGR180C 1038 nt2.15□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 DUF1YOL087C 3351 nt2.15□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 NEL1YHR035W 1893 nt2.15□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 ORC2YBR060C 1863 nt2.15□□□□□ -2.06
TY1B-GR3Q12316 YER121WYER121W 345 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YBL073WYBL073W 312 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 SYC1YOR179C 567 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 VMA9YCL005W-A 222 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 OSW5YMR148W 447 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YNL035CYNL035C 1170 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 SMY2YBR172C 2223 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 USO1YDL058W 5373 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 TPO5YKL174C 1857 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 RGA2YDR379W 3030 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 TPM2YIL138C 486 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 NUP157YER105C 4176 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 HOS4YIL112W 3252 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 PEX5YDR244W 1839 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 SCL1YGL011C 759 nt2.13□□□□□ -2.07
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