Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 SOK1YDR006C 2706 nt2.57□□□□□ -2
TIR4Q12218 SPP382YLR424W 2127 nt2.57□□□□□ -2
TIR4Q12218 CST9YLR394W 1449 nt2.57□□□□□ -2
TIR4Q12218 CBP2YHL038C 1893 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 REG1YDR028C 3045 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 EMP70YLR083C 2004 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 ROG1YGL144C 2058 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YPD1YDL235C 504 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 NKP1YDR383C 717 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YHR054CYHR054C 1065 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YKR011CYKR011C 1062 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YAR069CYAR069C 294 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 NNT1YLR285W 786 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YLR400WYLR400W 474 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YBL028CYBL028C 321 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 ERG29YMR134W 714 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 TPT1YOL102C 693 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 POL30YBR088C 777 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 VPS9YML097C 1356 nt2.56□□□□□ -2
TIR4Q12218 YIL169CYIL169C 2988 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 DUF1YOL087C 3351 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 snR68snR68 136 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 DUN1YDL101C 1542 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 AI2Q0055 2565 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 YCG1YDR325W 3108 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 YGR107WYGR107W 450 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 YJL049WYJL049W 1353 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 YLR108CYLR108C 1458 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 YLR278CYLR278C 4026 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 UBP8YMR223W 1416 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 SRP1YNL189W 1629 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 BNA4YBL098W 1383 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 ESA1YOR244W 1338 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 RRG7YOR305W 729 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 SRL4YPL033C 846 nt2.55□□□□□ -2
TIR4Q12218 IRC3YDR332W 2070 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 ERT1YBR239C 1590 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 YDR042CYDR042C 603 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 UBC5YDR059C 447 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 YDR203WYDR203W 318 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 MFA1YDR461W 111 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 YGL152CYGL152C 678 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 RNH203YLR154C 333 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 MRPL16YBL038W 699 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 ERG2YMR202W 669 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 SSN8YNL025C 972 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 HHF2YNL030W 312 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 YNR062CYNR062C 984 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 YPR050CYPR050C 414 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 NET1YJL076W 3570 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.54□□□□□ -2
TIR4Q12218 MPS1YDL028C 2295 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 GYP7YDL234C 2241 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 YBP2YGL060W 1926 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 RMD6YEL072W 696 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 COBQ0105 1158 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 THO1YER063W 657 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 SMX2YFL017W-A 234 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 MRPL9YGR220C 810 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 PIR1YKL164C 1026 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 YLR050CYLR050C 486 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 PEX27YOR193W 1131 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 MCA1YOR197W 1299 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 DPB3YBR278W 606 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 RIX1YHR197W 2292 nt2.53□□□□□ -2
TIR4Q12218 YKL222CYKL222C 2118 nt2.53□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 CDC37YDR168W 1521 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 RAD18YCR066W 1464 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 ESC2YDR363W 1371 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 TLC1TLC1 1301 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 YMR046CYMR046C 1323 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 PGD1YGL025C 1194 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 PNC1YGL037C 651 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 YGL109WYGL109W 324 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 UPF3YGR072W 1164 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 ATG10YLL042C 504 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 FAR3YMR052W 615 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 AAR2YBL074C 1068 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 YNL276CYNL276C 396 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 POP7YBR167C 423 nt2.52□□□□□ -2.01
TIR4Q12218 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms