Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 FIR1YER032W 2631 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YDL050CYDL050C 372 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 ARF1YDL192W 546 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 MCM21YDR318W 1107 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 IRC6YFR043C 714 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 PTI1YGR156W 1278 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YLL044WYLL044W 447 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YLR290CYLR290C 834 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YBL028CYBL028C 321 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YOR097CYOR097C 528 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YPL071CYPL071C 471 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 RDS2YPL133C 1341 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YDR186CYDR186C 2634 nt2.35□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 LRS4YDR439W 1044 nt2.34□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 IZH1YDR492W 951 nt2.34□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YGL218WYGL218W 651 nt2.34□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 TAN1YGL232W 870 nt2.34□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YHR097CYHR097C 1101 nt2.34□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.34□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 PBP2YBR233W 1242 nt2.34□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 RGA1YOR127W 3024 nt2.34□□□□□ -2.03
RIO1Q12196 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.34□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YMR046CYMR046C 1323 nt2.34□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 BNI4YNL233W 2679 nt2.34□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 NEL1YHR035W 1893 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 CTH1YDR151C 978 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 RPB9YGL070C 369 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 DCG1YIR030C 735 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 SDO1YLR022C 753 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 COS1YNL336W 1146 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 snR43snR43 209 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 EDS1YBR033W 2760 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YNL011CYNL011C 1335 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YOL057WYOL057W 2136 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 UBX3YDL091C 1368 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 KSP1YHR082C 3090 nt2.33□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YBT1YLL048C 4986 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 RED1YLR263W 2484 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 CWH41YGL027C 2502 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 AFI1YOR129C 2682 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 SCP160YJL080C 3669 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 TIF35YDR429C 825 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 TIM9YEL020W-A 264 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 SMX2YFL017W-A 234 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 AYR1YIL124W 894 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 SAW1YAL027W 786 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 APD1YBR151W 951 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 MBA1YBR185C 837 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 NUP170YBL079W 4509 nt2.32□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 VAC8YEL013W 1737 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 CLN3YAL040C 1743 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 EAP1YKL204W 1899 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 snR70snR70 164 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 BAT1YHR208W 1182 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 GAB1YLR459W 1185 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 TAF4YMR005W 1167 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 SPC24YMR117C 642 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YBL055CYBL055C 1257 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YNL043CYNL043C 321 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YNL046WYNL046W 519 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 END3YNL084C 1050 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 STH1YIL126W 4080 nt2.31□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YIL080WYIL080W 4722 nt2.3□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 RPL27BYDR471W 411 nt2.3□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YGL101WYGL101W 648 nt2.3□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 TRM112YNR046W 408 nt2.3□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 REG2YBR050C 1017 nt2.3□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 UBP2YOR124C 3819 nt2.3□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 SCY1YGL083W 2415 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 BRE1YDL074C 2103 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 MUS81YDR386W 1899 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 MCD1YDL003W 1701 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YEL075CYEL075C 369 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 RTT105YER104W 627 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 MRPL38YKL170W 417 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 ERV41YML067C 1059 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 DGR1YNL130C-A 147 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 THI80YOR143C 960 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 RPS10AYOR293W 318 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 DGK1YOR311C 873 nt2.29□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 SIP3YNL257C 3690 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 snR63snR63 255 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YGR064WYGR064W 369 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 YGR114CYGR114C 390 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 CIR1YGR207C 786 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 MPC3YGR243W 441 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 VMA6YLR447C 1038 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 HSC82YMR186W 2118 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 ATG19YOL082W 1248 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 RRG7YOR305W 729 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 UTP22YGR090W 3714 nt2.28□□□□□ -2.04
RIO1Q12196 PKP2YGL059W 1476 nt2.27□□□□□ -2.05
RIO1Q12196 MAK5YBR142W 2322 nt2.27□□□□□ -2.05
RIO1Q12196 EDC1YGL222C 528 nt2.27□□□□□ -2.05
RIO1Q12196 YIL024CYIL024C 570 nt2.27□□□□□ -2.05
RIO1Q12196 PAU14YIL176C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
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