Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA1Q09470 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms