Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms