Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 YJR030CYJR030C 2238 nt3.61□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 PUG1YER185W 912 nt3.61□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 YHL005CYHL005C 393 nt3.61□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 GPI14YJR013W 1212 nt3.61□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 YKR011CYKR011C 1062 nt3.61□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 SMA2YML066C 1110 nt3.61□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 MIT1YEL007W 2001 nt3.61□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 YCG1YDR325W 3108 nt3.61□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 PEX5YDR244W 1839 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 DRS2YAL026C 4068 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 VPS3YDR495C 3036 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 CDC37YDR168W 1521 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 YGR126WYGR126W 693 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 MRPL9YGR220C 810 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 VMA10YHR039C-A 345 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 SDP1YIL113W 630 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 YLR217WYLR217W 324 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 YOR387CYOR387C 621 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 MSB2YGR014W 3921 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 BUB1YGR188C 3066 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 MNT3YIL014W 1893 nt3.6□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 VPS33YLR396C 2076 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 YEL025CYEL025C 3567 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 YDL158CYDL158C 309 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 SLU7YDR088C 1149 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 RTT105YER104W 627 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 STE2YFL026W 1296 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 GOS1YHL031C 672 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 RPC37YKR025W 849 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 ATG3YNR007C 933 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 RPS7AYOR096W 573 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 GCY1YOR120W 939 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 SME1YOR159C 285 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 ATP20YPR020W 348 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 NMD2YHR077C 3270 nt3.59□□□□□ -1.83
SSP2Q08646 MDV1YJL112W 2145 nt3.59□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 ARP5YNL059C 2268 nt3.59□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 NUP159YIL115C 4383 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YIL169CYIL169C 2988 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 VAB2YEL005C 849 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YGR115CYGR115C 780 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 PET54YGR222W 882 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YHR212CYHR212C 336 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YAR060CYAR060C 336 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 GIM5YML094W 492 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 PFY1YOR122C 381 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 snR35snR35 204 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 VAC14YLR386W 2643 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 XRN1YGL173C 4587 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 HEF3YNL014W 3135 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 VTC4YJL012C 2166 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 DNA2YHR164C 4569 nt3.58□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 TCB2YNL087W 3537 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YDR061WYDR061W 1620 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 DAL2YIR029W 1032 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 MRP8YKL142W 660 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 NOP56YLR197W 1515 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 SUB1YMR039C 879 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 PDS5YMR076C 3834 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 MUB1YMR100W 1863 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 UBP8YMR223W 1416 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 SAS5YOR213C 747 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 CHS2YBR038W 2892 nt3.57□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 NMA111YNL123W 2994 nt3.56□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 RAD18YCR066W 1464 nt3.56□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 RMD6YEL072W 696 nt3.56□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YFL012WYFL012W 447 nt3.56□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 SPT4YGR063C 309 nt3.56□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YIL141WYIL141W 390 nt3.56□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YPR050CYPR050C 414 nt3.56□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 RXT2YBR095C 1293 nt3.56□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 FUS2YMR232W 2034 nt3.56□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 ATG21YPL100W 1491 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 SPO14YKR031C 5052 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 SMC2YFR031C 3513 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 NAB6YML117W 3405 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YDL242WYDL242W 354 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 TAD1YGL243W 1203 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 RPL6AYML073C 531 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YNL109WYNL109W 546 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 MSN1YOL116W 1149 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 PEX27YOR193W 1131 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 PEX1YKL197C 3132 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 SSE2YBR169C 2082 nt3.55□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 LCB4YOR171C 1875 nt3.54□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YFL015CYFL015C 495 nt3.54□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 ERP6YGL002W 651 nt3.54□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YGL109WYGL109W 324 nt3.54□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 AIM25YJR100C 984 nt3.54□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 YKL069WYKL069W 543 nt3.54□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 POP7YBR167C 423 nt3.54□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 MED8YBR193C 672 nt3.54□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 VPS64YDR200C 1815 nt3.54□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 CWH41YGL027C 2502 nt3.53□□□□□ -1.84
SSP2Q08646 ILS1YBL076C 3219 nt3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.6 ms