Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms