Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms