Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms