Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms