Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms