Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms