Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 AST2YER101C 1293 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 PRE8YML092C 753 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 FAR3YMR052W 615 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 YNL109WYNL109W 546 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 INO4YOL108C 456 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 YOR387CYOR387C 621 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 YPR050CYPR050C 414 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 YBP2YGL060W 1926 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 BCH1YMR237W 2175 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 YJL049WYJL049W 1353 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 MYO5YMR109W 3660 nt2.1□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 TPO5YKL174C 1857 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 LCB4YOR171C 1875 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 GYL1YMR192W 2163 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 MPS1YDL028C 2295 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 XRN1YGL173C 4587 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 YDL050CYDL050C 372 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 YDR250CYDR250C 276 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 OST6YML019W 999 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 SSN8YNL025C 972 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 THI80YOR143C 960 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 SLM4YBR077C 489 nt2.09□□□□□ -2.07
RDS3Q06835 AEP1YMR064W 1557 nt2.09□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 MUS81YDR386W 1899 nt2.09□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 AVT5YBL089W 1380 nt2.09□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YCG1YDR325W 3108 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 BPT1YLL015W 4680 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 MDV1YJL112W 2145 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 DOA4YDR069C 2781 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 HBT1YDL223C 3141 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 RTT105YER104W 627 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 RPB9YGL070C 369 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 IKI1YHR187W 930 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YHR212CYHR212C 336 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 GPI14YJR013W 1212 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 GPX1YKL026C 504 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YLL037WYLL037W 381 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YAR060CYAR060C 336 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 PRM6YML047C 1059 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 END3YNL084C 1050 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 SAS5YOR213C 747 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 RPL33AYPL143W 324 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YBR090CYBR090C 369 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 SRP1YNL189W 1629 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YMR046CYMR046C 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 FRE8YLR047C 2061 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 UBP8YMR223W 1416 nt2.08□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 PEX5YDR244W 1839 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 KAP95YLR347C 2586 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 RPN1YHR027C 2982 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ORC1YML065W 2745 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ITC1YGL133W 3795 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 GCD6YDR211W 2139 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 FMN1YDR236C 657 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 STE14YDR410C 720 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ERP6YGL002W 651 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 CWC23YGL128C 852 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 GOS1YHL031C 672 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 SUI2YJR007W 915 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 RPC25YKL144C 639 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YKR033CYKR033C 426 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ENV10YLR065C 546 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 SMD2YLR275W 333 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 UBC12YLR306W 567 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 PDR17YNL264C 1053 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ATG3YNR007C 933 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 GCY1YOR120W 939 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 HUA2YOR284W 732 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YPL107WYPL107W 747 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 GYP7YDL234C 2241 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 SYO1YDL063C 1863 nt2.07□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 TSC11YER093C 4293 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 PDS5YMR076C 3834 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ATG13YPR185W 2217 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ARP5YNL059C 2268 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 UBP14YBR058C 2346 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 IOC3YFR013W 2364 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 TAF2YCR042C 4224 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 MNT3YIL014W 1893 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YFL015CYFL015C 495 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 GTR2YGR163W 1026 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 COX3Q0275 810 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YJL032WYJL032W 315 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YLR050CYLR050C 486 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 CIN2YPL241C 807 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 snR35snR35 204 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ARL1YBR164C 552 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ENA5YDR038C 3276 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 RSE1YML049C 4086 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 NGG1YDR176W 2109 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 CST9YLR394W 1449 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 NOP56YLR197W 1515 nt2.06□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 VAC14YLR386W 2643 nt2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.6 ms