Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms