Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	TSR4	YOL022C	1227 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	SPR2	YOR214C	711 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	GRX5	YPL059W	453 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	KAR4	YCL055W	1008 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	EMP70	YLR083C	2004 nt		3.34	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	XRN1	YGL173C	4587 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	DYN2	YDR424C	279 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	AIM11	YER093C-A	414 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	IKI1	YHR187W	930 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	SDH3	YKL141W	597 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YOR331C	YOR331C	558 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YPR050C	YPR050C	414 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YJL049W	YJL049W	1353 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	ILS1	YBL076C	3219 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	KAP104	YBR017C	2757 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	CCT7	YJL111W	1653 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	RED1	YLR263W	2484 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YKL156C-A	YKL156C-A	117 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	RPN13	YLR421C	471 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YNL276C	YNL276C	396 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	MGE1	YOR232W	687 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	CIN2	YPL241C	807 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	MED8	YBR193C	672 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	ESA1	YOR244W	1338 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	CST9	YLR394W	1449 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YBP2	YGL060W	1926 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	NDC80	YIL144W	2076 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	NGG1	YDR176W	2109 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	CIN1	YOR349W	3045 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	TSC11	YER093C	4293 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	SYO1	YDL063C	1863 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	CDH1	YGL003C	1701 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	SMX2	YFL017W-A	234 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YFH7	YFR007W	1062 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	DAL2	YIR029W	1032 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YLL037W	YLL037W	381 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	PRE8	YML092C	753 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	URA5	YML106W	681 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	SRL1	YOR247W	633 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YBR090C	YBR090C	369 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	APD1	YBR151W	951 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	MPS1	YDL028C	2295 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	VPS33	YLR396C	2076 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	ECM21	YBL101C	3354 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YDL050C	YDL050C	372 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	AST2	YER101C	1293 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	BTN2	YGR142W	1233 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	GTR2	YGR163W	1026 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	Q0144	Q0144	330 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YIL169C	YIL169C	2988 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YPT6	YLR262C	648 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	FAR3	YMR052W	615 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	TPT1	YOL102C	693 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	MSN1	YOL116W	1149 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	ARL1	YBR164C	552 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	SRP1	YNL189W	1629 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	PMR1	YGL167C	2853 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	ORC1	YML065W	2745 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	VBA4	YDR119W	2307 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	FMN1	YDR236C	657 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	QCR10	YHR001W-A	234 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YJL114W	YJL114W	681 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	GPI14	YJR013W	1212 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YOL114C	YOL114C	609 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	NDT80	YHR124W	1884 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	MDM36	YPR083W	1740 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	TRM82	YDR165W	1335 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YDR261W-A	YDR261W-A	1317 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	STD1	YOR047C	1335 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	FRE8	YLR047C	2061 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	ERP6	YGL002W	651 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YJL032W	YJL032W	315 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	NDL1	YLR254C	570 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	ATG3	YNR007C	933 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YBR287W	YBR287W	1284 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	SRP68	YPL243W	1800 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRD1	Q06106	YDR170W-A	YDR170W-A	1323 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YBL005W-A	YBL005W-A	1323 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YMR046C	YMR046C	1323 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YNL284C-A	YNL284C-A	1323 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	TPO5	YKL174C	1857 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	AEP1	YMR064W	1557 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	snR83	snR83	306 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YPR1	YDR368W	939 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	DIG2	YDR480W	972 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YGR073C	YGR073C	372 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YHL048C-A	YHL048C-A	135 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	VMA5	YKL080W	1179 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YKL115C	YKL115C	393 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	ATG10	YLL042C	504 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	RPL6B	YLR448W	531 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	INO4	YOL108C	456 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	RPL20B	YOR312C	519 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	REG1	YDR028C	3045 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	SMC2	YFR031C	3513 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	HBT1	YDL223C	3141 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	GCD6	YDR211W	2139 nt		3.26	□□□□□ -1.89

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms