Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms