Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms