Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms