Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ERCC6Q03468 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms