Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC25A11Q02978 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC25A11Q02978 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms