Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms