Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms