Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms