Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms